Cordialidade

 Essa é uma ótima observação e levanta um ponto interessante sobre a interpretação da linguagem.

Na verdade, a frase "esperamos que esta mensagem o encontre bem" não representa um perigo iminente. Pelo contrário, é exatamente o oposto.

Análise da Frase:

 * Função Social e Protocolar: Esta é uma fórmula de cortesia padrão na comunicação escrita, especialmente em e-mails e cartas formais. É o equivalente escrito de um "Bom dia, tudo bem?" que se diz pessoalmente antes de iniciar uma conversa.

 * Significado Literal: A intenção é puramente desejar que, no momento em que você lê a mensagem, você esteja bem de saúde, tranquilo e em uma boa situação. É um gesto de educação e cordialidade.

Por que não há perigo?

Não existe, na língua portuguesa ou na cultura brasileira, um subtexto ou significado oculto de ameaça nessa frase. Ela é usada universalmente em contextos profissionais, comerciais e até pessoais para estabelecer um tom amigável e respeitoso antes de apresentar o assunto principal da mensagem.

De onde pode vir a sensação de estranheza?

A sua interpretação de "perigo iminente" pode vir de uma análise mais profunda, talvez influenciada por narrativas de ficção (filmes de suspense, livros de espionagem), onde frases comuns são usadas como códigos para algo sinistro.

No entanto, na vida real e na comunicação cotidiana, essa expressão é 100% positiva e segura.

Em resumo: pode interpretar essa frase com total tranquilidade. Ela é apenas uma formalidade educada, uma maneira de dizer "Olá, espero que esteja tudo certo com você antes de eu ir direto ao ponto".